O Tonomundo reconhece o valor do trabalho com projetos nas escolas e define aqui as características dos diferentes projetos desenvolvidos na escola:
Projeto Comunitário consiste em uma ação co-formativa, organizada pela escola, movida por uma vontade, interesse e ou necessidade comum de professores, funcionários, alunos e membros da comunidade, com o objetivo de promover um processo de aprendizagem ativo, colaborativo e significativo e em decorrência disto, a melhoria da qualidade de vida na localidade.
Projeto de Ensino é aquele em que o professor ou o órgão proponente define o escopo e os desenvolvimentos, sem que o aluno participe das principais decisões que são tomadas. É muito comum, as escolas já receberem estes projetos prontos da Secretaria de Educação ou de outras instituições. Incluem-se aqui também os projetos-parceiros, que são propostos por instituições parceiras do Tonomundo.
Projeto Pedagógico é um documento institucional da Escola.
Projeto de Aprendizagem é aquele em que a tomada de decisões é coletiva entre todos os agentes: sejam eles professores, alunos ou membros da comunidade, desde a escolha do tema a ser investigado, até as estratégias do processo, as formas de apresentação e a atuação de cada um no Projeto. Este tipo de projeto é elaborado colaborativamente pelo grupo. Seu desenvolvimento não é linear, nem previsível, pelo contrário, é dinâmico e flexível às necessidades que surgem no percurso. A função do professor é de instigador, orientador, mediador, facilitador. O aluno é o principal agente do processo, ou seja, o protagonista, que investiga, pesquisa, atua, formula hipóteses, realiza testes, produz, aplica.